一直渴望着力量吧！在过去的十几年里，陆峰周转于三大天使的城堡，进行着自己的修业。在基路比兽的城堡里，他找到了数码世界最大的图书馆，了解了当前的历史。
数码兽是随着人类世界信息技术的发展而诞生和繁衍而来的。数码世界的核心是信息，信息组成了有意义的数据段，然后诞生了三大种，即资料种、疫苗种、病毒种。人类世界的信息交流越来越频繁，数码世界里相应的数码兽就越多。
终于在遥远的史前时代，由于数码兽的过度增殖，造成数据空前膨胀，终于引发了普遍性数码世界危机。鉴于数码世界可用率越来越低的现状，掌管总信息的主系统伊古德拉希尔（yggdrasil），即世界树创建了新数码世界，并将一部分选中的数码兽转移过去。对于剩余的数码兽以及旧数码世界，则用“x程序”予以彻底毁灭，称为“方舟计划”。
x程序能够侵染数码兽的心脏“数码核”。但凡被感染的数码兽，死亡率高达98，然而有2的个体，产生与现实生物相似的特异性免疫反应，自身制造出“x抗体”从而免于死亡，并设法逃到了新数码世界。世界树命令手下的皇家骑士将之消灭。
就在这个时候有两个人类少年分别进入了新旧世界，并与带有x抗体的两只数码兽成为了伙伴。并与皇家骑士战斗。经过重重困难之后，终于诞生了传说中的王龙，与第十三位皇家骑士，“虚空之位”的主人——阿尔法兽！
最终阿尔法兽手持究极战刃王龙剑打败了世界树制造的爪牙death－x，拯救了世界。但是，阿尔法兽执着于消灭世界树，被奥米加兽x所阻止。世界树也在皇家骑士的压力
第三章 史前、超古代与古代(2/6)